Skupštinu Instituta imenuje Vlada Republike Srbije. Članovi Skupštine se biraju iz reda istraživača u naučnom zvanju, kompetentnih za naučnu oblast kojom se Institut bavi.
U skladu sa zaključkom Vlade Republike Srbije za vršioce dužnosti predstavnika Republike Srbije, kao osnivača Instituta „Mihajlo Pupin“, odredjeni su:
- Prof. dr Željko Đurović, dipl. inž.
Elektrotehnički fakultet, Beograd
Predsednik Skupštine - Prof. dr Radivoje Mitrović, dipl. inž.
Mašinski fakultet, Beograd - Prof. dr Milo Tomašević, dipl. inž.
Elektrotehnički fakultet, Beograd - Dr Aleksandar Rodić, dipl. inž.
Naučni savetnik, IMP, Beograd